O exame anatomopatológico é realizado em uma peça (orgão) ou fragmento de tecido (biópsia) retirado do paciente. Primeiramente, esse tecido é fixado em formol tamponado para garantir a integridade da amostra, é analisado macroscopicamente para verificação de lesões e/ou padrões sugestivos de uma doença e posteriormente esse material é processado para realização de cortes finos com micrótomo. Assim, o patologista pode analisar ao microscópio, com maior precisão, a forma das células, seu conteúdo, a organização do tecido e sua estrutura, chegando a descrição da patologia (doença) que possa estar acometendo o indivíduo.