• Hibridização in situ para EBV
• Hibridização in situ para HER-2 (SISH)
• Amplificação de gene HER-1 (EGFR)
• Amplificação de N-MYC - Neuroblastoma
• Rearranjo gênico EWSR1 - Sarcoma
• Rearranjo gênico CHOP (12q1) - Lipossarcoma
• Rearranjo gênico SYT (8q11) - Sarcoma sinovial
• Deleção gênica 1p/19q - Oligodendroglioma (FISH deleção 1p19q)
• Rearranjo gênico BCL2 - Linfoma folicular
• Rearranjo gênico BCL6 - Linfoma folicular
• Translocação AP12/MALTI t(11;18) - Linfoma marginal
• Translocação IGH/CCNDI t(11;14) - Linfoma manto
• Amplificação do gene MDM2 - Lipossarcoma
• Rearranjo gênico MYC
• Estudo alteração gênica ALK (EML4/ALK)
• Amplificação do gene C-MET
• Rearranjo do gene ROS I
• Rearranjos envolvendo o gene FOX01 (FKHR) - Rabdomiossarcoma alveolar
• Rearranjo do gene TFE3
• Rearranjo do gene RET
• Translocação CIC/DUX4
• Translocação igh/bcl2 T(14;18)
• Translocação do gene DUSP 22
• Translocação do gene DUSP 6
• Rearranjo do gene CDKN2A